Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Apba1B2RUJ5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Apba1B2RUJ5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms