Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ythdc2B2RR83 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ythdc2B2RR83 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ythdc2B2RR83 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ythdc2B2RR83 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ythdc2B2RR83 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms