Protein–RNA interactions for Protein: B2RQT2

Vmn1r5, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r5B2RQT2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r5B2RQT2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r5B2RQT2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r5B2RQT2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r5B2RQT2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r5B2RQT2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms