Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms