Protein–RNA interactions for Protein: B1B212

H60b, Histocompatibility antigen 60b, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60bB1B212 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60bB1B212 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60bB1B212 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H60bB1B212 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60bB1B212 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H60bB1B212 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
H60bB1B212 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60bB1B212 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H60bB1B212 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms