Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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