Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms