Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8b5A3FIN4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8b5A3FIN4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8b5A3FIN4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8b5A3FIN4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8b5A3FIN4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp8b5A3FIN4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp8b5A3FIN4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp8b5A3FIN4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp8b5A3FIN4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Atp8b5A3FIN4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Atp8b5A3FIN4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Atp8b5A3FIN4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Atp8b5A3FIN4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Atp8b5A3FIN4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Atp8b5A3FIN4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Atp8b5A3FIN4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Atp8b5A3FIN4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp8b5A3FIN4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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