Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms