Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms