Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ttll9A2APC3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttll9A2APC3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms