Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FocadA2AKG8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms