Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Frmpd1A2AKB4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Frmpd1A2AKB4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms