Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pramel3A2AHA7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramel3A2AHA7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms