Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms