Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm2A2A7B5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms