Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrp1bA1Z198 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms