Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fam71e1A1L3C1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms