Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc112A0AUP1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms