Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms