Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms