Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms