Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vstm4T1NXB5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms