Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms