Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms