Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms