Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ilf3Q9Z1X4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ilf3Q9Z1X4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ilf3Q9Z1X4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ilf3Q9Z1X4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ilf3Q9Z1X4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms