Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lgr5Q9Z1P4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgr5Q9Z1P4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.3 ms