Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shcbp1Q9Z179 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shcbp1Q9Z179 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms