Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp5Q9Z131 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp5Q9Z131 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp5Q9Z131 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp5Q9Z131 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp5Q9Z131 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp5Q9Z131 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp5Q9Z131 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp5Q9Z131 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp5Q9Z131 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh3bp5Q9Z131 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms