Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skp2Q9Z0Z3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms