Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nup160Q9Z0W3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nup160Q9Z0W3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nup160Q9Z0W3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nup160Q9Z0W3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Nup160Q9Z0W3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nup160Q9Z0W3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nup160Q9Z0W3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Nup160Q9Z0W3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nup160Q9Z0W3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nup160Q9Z0W3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Nup160Q9Z0W3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nup160Q9Z0W3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nup160Q9Z0W3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Nup160Q9Z0W3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nup160Q9Z0W3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nup160Q9Z0W3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nup160Q9Z0W3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nup160Q9Z0W3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nup160Q9Z0W3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nup160Q9Z0W3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nup160Q9Z0W3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nup160Q9Z0W3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nup160Q9Z0W3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms