Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slit3Q9WVB4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slit3Q9WVB4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Slit3Q9WVB4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slit3Q9WVB4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slit3Q9WVB4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slit3Q9WVB4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slit3Q9WVB4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slit3Q9WVB4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slit3Q9WVB4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slit3Q9WVB4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slit3Q9WVB4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slit3Q9WVB4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slit3Q9WVB4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slit3Q9WVB4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Slit3Q9WVB4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Slit3Q9WVB4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slit3Q9WVB4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms