Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn3Q9WUK7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms