Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mixl1Q9WUI0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mixl1Q9WUI0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms