Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkraQ9WTX2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms