Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms