Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms