Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf10bQ9QZM4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms