Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms