Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB1

Clic4, Chloride intracellular channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic4Q9QYB1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clic4Q9QYB1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms