Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms