Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn4Q9QXZ9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms