Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY1

Tjp3, Tight junction protein ZO-3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp3Q9QXY1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tjp3Q9QXY1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tjp3Q9QXY1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tjp3Q9QXY1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tjp3Q9QXY1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tjp3Q9QXY1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tjp3Q9QXY1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tjp3Q9QXY1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tjp3Q9QXY1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tjp3Q9QXY1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms