Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT0

Cnpy2, Protein canopy homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy2Q9QXT0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnpy2Q9QXT0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnpy2Q9QXT0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnpy2Q9QXT0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnpy2Q9QXT0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnpy2Q9QXT0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnpy2Q9QXT0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnpy2Q9QXT0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnpy2Q9QXT0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnpy2Q9QXT0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnpy2Q9QXT0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnpy2Q9QXT0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnpy2Q9QXT0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnpy2Q9QXT0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnpy2Q9QXT0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnpy2Q9QXT0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnpy2Q9QXT0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnpy2Q9QXT0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnpy2Q9QXT0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cnpy2Q9QXT0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnpy2Q9QXT0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnpy2Q9QXT0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnpy2Q9QXT0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnpy2Q9QXT0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnpy2Q9QXT0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnpy2Q9QXT0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnpy2Q9QXT0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnpy2Q9QXT0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnpy2Q9QXT0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnpy2Q9QXT0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms