Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad18Q9QXK2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms