Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms