Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mid2Q9QUS6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms