Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Dkk3Q9QUN9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms