Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tlr4Q9QUK6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr4Q9QUK6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms